Grundsätzlich kann an der Fakultät für Chemie und Pharmazie in jedem an der Fakultät angesiedelten Fachgebiet promoviert werden.

Interessenten müssen sich vor Aufnahme der Tätigkeiten eine Betreuerin oder einen Betreuer ihrer Arbeit an der Fakultät suchen, die oder der bereit ist, das Thema fachlich zu begleiten und die Infrastruktur zur Verfügung zu stellen. In der Regel handelt es sich hierbei um Themengebiete aus den Forschungsgebieten der an der Fakultät tätigen Professorinnen und Professoren.

Zur Betreuung des laufenden Promotionsverfahrens wird zu Beginn ein Fachmentorat eingesetzt, das von der oder dem Vorsitzenden bestellt wird. Das Fachmentorat berät Doktorandinnen und Doktoranden in fachlicher Hinsicht, fördert deren wissenschaftliche Entwicklung und wacht über den Fortschritt des Promotionsverfahrens. Das Fachmentorat besteht aus bis zu drei Hochschullehrerinnen oder Hochschullehrern, von denen eine/r die/der Hauptbetreuer/-in ist. Das Thema der Dissertation soll aus dem Fachgebiet dieser Person stammen. 

In seltenen Fällen kann die Ehrenpromotion und damit der Grad eines Doktors der Naturwissenschaften ehrenhalber verliehen werden. Die ausgezeichneten Persönlichkeiten haben sich durch hervorragende wissenschaftliche Leistungen in einem oder mehreren Fachgebieten verdient gemacht, die an der Fakultät für Chemie und Pharmazie angesiedelt sind.